Kuus Eesti Metodisti Kiriku vaimulikku teenivad kaplanitena vanglates, Kaitseväes ja Kaitseliidus. Kaplanid viivad läbi palvusi, jumalateenistusi, leerikursusi, ristimisi, armulauatalitusi, matuseid, pühitsemisi, Piiblitunde, eetikatunde ning hingehoidlikke vestlusi. Kaitseväe ja Kaitseliidu kaplanid toetavad langenud kaitseväelaste peresid, osalevad paraadidel, aastapäevadel, konverentsidel ja koolitustel. Vanglakaplanid viivad läbi sotsiaalprogrammi sõltlastele, edastatakse surmateateid peredele, külastatakse haigeid kinnipeetavaid ning jagatakse usulist kirjandust ja sümboolikat.